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核酸电泳总“翻车”?6× Loading Buffer配方、配制、选型全搞定

发布日期: 2026-07-18
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核酸电泳总“翻车”?6× Loading Buffer配方、配制、选型全搞定

  上样后样品浮出点样孔、电泳跑完条带弥散不清、明明有扩增却什么都看不见……这些在核酸电泳中最常见的“疑难杂症”,很多时候并非DNA或RNA本身出了问题,症结往往出在上样缓冲液(Loading Buffer) 的选择与使用上。

  作为核酸电泳中不可或缺的核心试剂,6× DNA Loading Buffer究竟是什么、如何配制、不同配方之间该如何选择?这篇文章帮您系统梳理。

一、Loading Buffer在核酸电泳中扮演什么角色?

6× DNA Loading Buffer(6倍浓缩上样缓冲液)在样品上样前必须加入,它承担四项基本职能:

  • 增加样品密度——通过甘油、蔗糖或Ficoll等增稠剂,使样品沉入点样孔底部,避免上样时飘出孔外。

  • 提供电泳指示——溴酚蓝、二甲苯青FF等示踪染料在电场中随核酸一同向前迁移,实时反映电泳进度。

  • 保护核酸完整性——EDTA螯合体系中的金属离子,有效抑制核酸酶对DNA/RNA的降解。

  • 改善样品沉降——增稠剂还能减少样品在点样孔中的扩散,使条带更加集中。

之所以设计为6倍浓缩(6×) ,是为了使用时按 1份缓冲液 + 5份样品 的比例混合,稀释至1×工作浓度后上样。

二、主流配方对比与关键参数

市面上常见的6× Loading Buffer主要有三大类型,区别集中于增稠剂种类染料组合以及是否含SDS。以下数据经多来源交叉验证:[1][2][3]

核心组分经典甘油型Ficoll型SDS型(如Sigma G2526)
增稠剂30–40% 甘油12–15% Ficoll 40040% 蔗糖
金属螯合剂30–50 mM EDTA30 mM EDTA0.1 M EDTA(pH 8.0)
示踪染料10.05–0.25% 溴酚蓝0.06% 溴酚蓝0.05% 溴酚蓝
示踪染料20.05–0.25% 二甲苯青FF0.06% 二甲苯青FF
蛋白变性剂0.50% SDS
缓冲体系可选Tris-HCl(pH 7.6)

染料迁移参考值(1%琼脂糖凝胶,仅供参考,实际受凝胶浓度、缓冲液类型影响):

  • 二甲苯青FF:TAE中约相当于4,000 bp;TBE中约4,000–5,000 bp。

  • 溴酚蓝:TAE中约300–500 bp;TBE中约300 bp。

重要提示:含SDS的Loading Buffer具有蛋白变性能力,适用于蛋白含量较高的粗提样品。若后续涉及切胶回收限制性酶切实验,请选择不含SDS的版本,以免SDS干扰下游酶学反应。

三、标准配制方案详解(以经典甘油型为例,配制10 mL)

本方案采用0.25%染料浓度,适配常规琼脂糖凝胶电泳。若偏好更浅的背景色,可酌情减半至0.1–0.125%。

所需试剂清单

组分用量备注
去离子水~5 mL(初溶)+ 补足至10 mL溶解染料用
溴酚蓝0.025 g终浓度0.25%
二甲苯青FF0.025 g终浓度0.25%
0.5 M EDTA(pH 8.0)0.6 mL终浓度~30 mM
甘油3 mL终浓度30%

逐步操作流程

  1. 染料预溶解:取一支15 mL离心管,加入约5 mL去离子水。先后加入0.025 g溴酚蓝和0.025 g二甲苯青FF,建议先加少量水将染料调成糊状,再逐步稀释,涡旋振荡至完全溶解,此时溶液应呈深蓝紫色、无肉眼可见颗粒。

  2. 添加EDTA:加入0.6 mL 0.5 M EDTA母液(pH 8.0),充分混匀。

  3. 加入甘油:加入3 mL甘油,剧烈涡旋振荡30秒至体系完全均一。

  4. 定容:补加去离子水至10 mL,盖紧管盖,上下颠倒混匀10–15次,再次短暂涡旋。

  5. 分装保存:按单次使用量分装(建议500 μL/管),室温避光保存(锡纸包裹或置于不透明管盒中)。如需保存超过6个月,可转移至-20°C冻存,尽量避免反复冻融。

  6. 沉淀处理:若长期存放后出现沉淀,65°C加热10分钟,涡旋复溶后即可正常使用。

操作备忘

  • 染料完全溶解是关键步骤,请确保无颗粒残留。

  • 本配方无需调节pH。

  • 使用比例:每5 μL核酸样品 + 1 μL 6× Loading Buffer,混匀瞬时离心后上样。

四、不同实验场景下的选型建议

应用场景推荐类型判断依据
PCR产物、纯化后DNA/RNA无SDS型(甘油型或Ficoll型)避免SDS抑制后续酶切、连接或回收
粗提核酸(含蛋白杂质较多)SDS型SDS可解离DNA-蛋白复合物,改善条带形态
切胶回收目的片段无SDS型保证回收效率和下游实验成功率
SDS-PAGE蛋白电泳SDS型(含DTT/β-ME的蛋白专用型)本品不适用,需选用蛋白电泳专用上样缓冲液

五、常见问题快速排查

现象根源分析解决方案
样品上样后飘出孔外增稠剂比例不足或混合不匀确保缓冲液与样品充分混匀,检查甘油浓度
条带模糊、拖尾严重DNA降解或上样量过大确认EDTA有效;适当减少上样量
染料前缘扭曲或呈现笑脸电泳电压过高或凝胶不均降低电压,重新制胶
储存后出现肉眼可见沉淀低温析出或蒸发浓缩65°C加热复溶后涡旋混匀即可
切胶回收后下游实验失败误用了含SDS的Loading Buffer切换为无SDS版本再试

六、即用型产品:把时间留给真正的实验

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  自行配制Loading Buffer虽然可行,但称量微小剂量染料、等待完全溶解、担忧沉淀析出——这些琐事消耗的不仅是时间,更是实验的稳定性。

  杭州富沃克生物科技有限公司 推出即用型6× DNA Loading Buffer,严格参照标准配方质控生产,溶液均一、无沉淀,开瓶即用。助您跳过配制环节的不确定性,让每一次上样都稳定可靠。

产品信息:

产品名称规格产品货号
6X Loading Buffer1 mL / 10 mLFLB606-01

了解更多详情,欢迎咨询杭州富沃克生物科技有限公司。

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参考文献

[1] Sigma-Aldrich. Gel Loading Buffer 6X Tracking Dye. Product G2526
[2] b.j.vanbergenhenegouwen. Request for a 6x gel loading buffer receipt. bionet.molbio.methds-reagnts, 1999. IUBio Archive.
[3] Yeasen Biotechnology. 6× DNA Loading Buffer. Product 10213ES