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Technical article别再让RNA污染你的DNA样品了:RNase A配制到使用的完整操作手册
质粒提取后跑胶,RNA条带明晃晃地出现在胶图上;DNA样品纯度检测时A260/A280比值异常——这些问题的根源,往往指向同一个方向:DNA样品中混入了RNA。
RNase A处理是去除RNA污染的标准方法。本文将系统梳理RNase A的核心功能、两种经典储备液配制方案、关键操作细节及实验注意事项。
RNase A(核糖核酸酶A)是一种内切核糖核酸酶,专门在RNA的嘧啶残基(C和U)位置“下刀”,把RNA切成小片段。
在质粒DNA或基因组DNA制备中,它的核心任务就是清除溶液中的RNA,不让它污染DNA样品。它像一把“专切RNA的剪刀”——锋利、稳定、不挑食。RNase A溶液的核心目标有两个:把RNase A溶解好,同时把DNase活性彻底干掉。
市面上最经典的配制方法有两种,核心区别在于溶解缓冲液和加热条件:
| 对比项 | 方案一(醋酸钠法) | 方案二(Tris-NaCl法) |
|---|---|---|
| RNase A粉末 | 100 mg | 100 mg |
| 溶解缓冲液 | 10 mM 醋酸钠(pH 5.2) | 10 mM Tris-HCl(pH 7.5)+ 15 mM NaCl |
| 终体积 | 10 mL | 10 mL |
| 终浓度 | 10 mg/mL | 10 mg/mL |
| 加热条件 | 100℃煮沸 15 min | 100℃煮沸 5-15 min |
| 冷却后调pH | 加1/10体积的1M Tris-HCl调至pH 7.4 | 一般无需额外调pH |
| 保存 | -20℃分装保存 | -20℃分装保存 |
两种方案各有优点。方案一是《分子克隆》中的经典方法,煮沸在酸性条件下进行,RNase不易沉淀;方案二操作更简洁,煮沸后直接使用。
RNase A粉末(100 mg)
10 mM 醋酸钠缓冲液(pH 5.2)
1M Tris-HCl(pH 7.4)
洁净离心管、移液器及无菌枪头
| 步骤 | 操作 | 关键说明 |
|---|---|---|
| ① 称量 | 精确称取 100 mg RNase A粉末 | 置于干净的离心管或烧杯中 |
| ② 溶解 | 加入 10 mL 10 mM 醋酸钠缓冲液(pH 5.2) | 轻轻吹打或搅拌至完全溶解,终浓度为10 mg/mL |
| ③ 煮沸 | 将溶液放入100℃沸水浴中加热 15分钟 | 此为灭活DNase的最关键保障 |
| ④ 缓慢冷却 | 取出后室温缓慢冷却 | 不要放冰上急冷——缓慢降温有助于RNase A维持正确构象 |
| ⑤ 调pH | 加入 1/10体积(即1 mL)的1M Tris-HCl(pH 7.4) | 将溶液pH调整至7.4左右,适合后续实验使用 |
| ⑥ 沉淀处理 | 如有可见沉淀,10000 rpm离心2分钟,取上清分装;或使用0.22 μm滤器过滤除菌 | — |
| ⑦ 分装保存 | 分装成小份(建议每管100-200 μL),-20℃冻存 | 避免反复冻融,可稳定保存2年以上 |
| 控制点 | 要求/措施 | 原因/说明 |
|---|---|---|
| DNase污染 | 使用洁净耗材和灭菌水 | 煮沸步骤是灭活DNase的最关键保障 |
| 煮沸pH条件 | 酸性(pH 5.2)条件下煮沸,冷却后再调至中性 | 中性pH下煮沸会导致RNase A沉淀 |
| 工作浓度 | 储备液10 mg/mL,使用时稀释至1~100 μg/mL | 质粒提取中往溶液I加RNase A至终浓度100 μg/mL左右(具体以试剂盒说明书为准) |
| 保存方式 | 小量分装(每管100-200 μL),-20℃恒定保存 | 每管只取一次用量,避免反复冻融 |
| 产品级别 | 普通级RNase A冻干粉适用本方法 | 分子生物学级(DNase free)或色谱纯化级产品请直接参照说明书溶解,无需煮沸 |
| 异常现象 | 可能原因 | 解决方案 |
|---|---|---|
| DNA样品中RNA残留明显 | RNase A用量不足或活性下降 | 增加工作浓度;检查储备液是否反复冻融 |
| 煮沸后溶液出现沉淀 | 中性pH下煮沸或冷却过快 | 确保在pH 5.2条件下煮沸;缓慢冷却 |
| 酶活性下降 | 反复冻融或保存不当 | 分装保存,避免反复冻融 |
| DNase残留污染DNA | 煮沸时间不足或温度不够 | 确保100℃煮沸至少15分钟 |

自行配制RNase A涉及称量、煮沸灭活DNase、缓慢冷却、调pH、分装等多个环节——每一个细节的疏忽都可能影响酶活性和DNA样品的纯度。更不用说处理过程中的RNase A粉末飞扬问题。
杭州富沃克生物科技有限公司推出的RNase A溶液,经过严格处理,不含DNase和蛋白酶,开盖即用,无需热处理。10 mg/mL的浓度直接对标经典配方,你只需要根据实验需求稀释至工作浓度即可。把配制的麻烦交给专业厂家,把时间留给真正重要的实验。
| 产品名称 | 规格 | 产品货号 |
|---|---|---|
| RNase A溶液 | 1 mL | FRN606-01 |
厂家联系微信号:19850855600
邮箱:support@fwkbio.com
参考文献
[1] Sambrook J, Fritsch EF, Maniatis T. Molecular cloning: a laboratory manual. 2nd ed. Cold Spring Harbor (NY): Cold Spring Harbor Laboratory Press; 1989.
[2] Sambrook J, Russell DW. Molecular Cloning: A Laboratory Manual. 3rd ed. Cold Spring Harbor Laboratory Press; 2001.
[3] Ribonuclease A from bovine pancreas (R4875) – Preparation Instructions. Sigma-Aldrich.
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